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<journal-title specific-use="original" xml:lang="es">Tecnología Química</journal-title>
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<subject>Sin sección</subject>
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<article-title xml:lang="es">Análisis in silico de un cultivo de células de mamíferos en biorreactores semicontinuos de dos etapas</article-title>
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<trans-title xml:lang="en">In silico analysis of a mammalian cell culture in two stage fed-batch bioreactors</trans-title>
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<p>Departamento de Ingeniería Química. Universidad de Camagüey “Ignacio Agramonte Loynaz”, Camagüey, Cuba</p>
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<year>2017</year>
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<volume>XXXVII</volume>
<issue>3</issue>
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<title>Resumen</title>
<p>El objetivo de este trabajo es comparar un sistema de cultivo de células de mamíferos semicontinuo en dos etapas con uno de simple etapa. Se utilizaron las técnicas de diseño <italic>in silico </italic>para intensificar la producción de anticuerpos monoclonales (AcM) en ambas variantes antes de compararlas. Se utilizó como caso de estudio un modelo cinético mixto de células de hibridoma reportado en la literatura. La simulación computacional se realizó utilizando la plataforma computacional <underline>MATLAB</underline>. Los resultados demostraron que en un sistema semicontinuo de doble etapa, pudiera lograse una productividad significativamente mayor de AcM que en uno de simple etapa. En el caso estudiado, en doble etapa, con una fracción de volumen de la primera etapa del 80 %, se alcanzan incrementos de las concentraciones del AcM del 58 % respecto a la variante de simple etapa; lo que representa un incremento de productividad del AcM de un 30 %.</p>
</abstract>
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<title>Abstract</title>
<p>The objective of this work is to compare a two-stage fed-batch culture system of mammalian cells with a single culture system. In silico process-design techniques were used in order to intensify the production of monoclonal antibodies in both cases before comparing them. As case study a structured kinetic model reported in literature for an industrial process of monoclonal antibodies (MAb) harvested from cultures of hybridoma cells was selected. Computational simulation was carried-out using MATLAB software as computing platform. Results demonstrated that in this particular case a two-stage fed-batch culture system produces higher productivities in MAb production compared to simple stage systems. In double stage systems, having a fraction of volume of the first stage of 80 %, an increment of 58 % in MAb concentrations and 30 % in productivity were obtained when compared to a single stage system.</p>
</trans-abstract>
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<title>Palabras clave</title>
<kwd>cultivo de células</kwd>
<kwd>anticuerpos monoclonales</kwd>
<kwd>optimización</kwd>
<kwd>biorreactor semicontínuo de dos etapas</kwd>
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<title>Keywords</title>
<kwd>Cell culture</kwd>
<kwd>monoclonal antibodies</kwd>
<kwd>optimization</kwd>
<kwd>two-stage semi-continuous bioreactor</kwd>
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<sec>
<title>
<bold>Introducción</bold>
</title>
<p>La producción de proteínas con fines terapéuticos en células de mamíferos es actualmente una rama productiva de atractivos económicos, tanto por los volúmenes actuales de ventas como por el ritmo de crecimiento observado en años recientes <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref7">7</xref>]</sup>
</bold>. Hay cifras muy alentadoras. Por ejemplo, en el año 2004, el mercado global de proteínas terapéuticas fue de 44 billones de USD y para el 2010 se estimó en 70 billones de USD <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref17">17</xref>]</sup>
</bold>. De todo este mercado, sólo las ventas de anticuerpos monoclonales se estimaron en 35 billones de USD en el año 2009 <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref13">13</xref>]</sup>
</bold>. Así mismo, según citan <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref9">9</xref>]</sup>
</bold> en un reporte del 2007 se estimaba que el mercado biotecnológico en general se duplicará hacia el 2020.</p>
<p>Las células de mamíferos constituyen actualmente el sistema de expresión preferido para la obtención de proteínas con aplicaciones médicas. Esto se debe a su capacidad de sintetizar proteínas muy complejas que requieren grandes modificaciones post-traslacionales <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref3">3</xref>]</sup>
</bold>. Sin embargo, los altos niveles de inversión y los elevados costos de investigación en los que se incurre, así como los notables tiempos de cultivo necesarios en este tipo de sistema, demandan de una reducción de costos y del tiempo necesario para colocar los productos en el mercado <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref16">16</xref>]</sup>
</bold>. En esencia, se necesita identificar las condiciones óptimas para que estas células expresen la mayor cantidad de proteína con el menor gasto.</p>
<p>En la solución de este tipo de problemas existe un creciente uso de estrategias de investigación basadas en el diseño <italic>in silico </italic>de procesos, es decir, usando la modelación matemática y la simulación de procesos <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref19">19</xref>]</sup>
</bold>. Esta estrategia ofrece importantes ventajas respecto a las empíricas que aún se utilizan <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref10">10</xref>]</sup>
</bold>, brinda la posibilidad de comprensión cabal del proceso, complementa el conocimiento ya disponible con nuevos datos y reduce el tiempo y el costo de desarrollo del producto. El diseño de procesos se resuelve entonces acudiendo a los métodos de optimización <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref20">20</xref>]</sup>
</bold>, con auxilio de la simulación computacional.</p>
<p>Hasta la fecha se han utilizado diferentes sistemas de cultivo, pero los más frecuentes son los biorreactores de tanque agitado en operación semicontinua (BSCTA) y los biorreactores continuos con perfusión (BCTAP), ambos en simple etapa <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref8">8</xref>]</sup>
</bold>. El BSCTA (fed-batch) es muy empleado mundialmente en la actualidad por su simplicidad y buenos resultados [5;6]. En la práctica se emplean perfiles de alimentación variables con vistas a conseguir el mejor desempeño del proceso <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref2">2</xref>;<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref14">14</xref>]</sup>
</bold>. A partir del trabajo de <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref1">1</xref>]</sup>
</bold>, se ha estimado un valor de productividad de anticuerpo en un BSCTA de 5 g año<sup>-1.-1</sup>. Este valor es bajo comparado con los resultados de<bold>
<sup> [<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref11">11</xref>]</sup>
</bold>, de los que se estimó una productividad de 55,24 g año<sup>-1.-1</sup>, luego de realizar cambios en la operación del biorreactor en un sistema continuo con perfusión. Estos niveles de productividad estimados de la literatura muestran el potencial diferente de estas dos operaciones, sin embargo, se puede afirmar que aún son bajos y no lograrán suplir la creciente demanda de productos basados en AcM <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref4">4</xref>]</sup>
</bold>.</p>
<p>Las estrategias de cultivo relacionadas con cambios en la estructura del sistema de contacto ha sido poco tratada. Recientemente se demostró teóricamente que con un sistema de dos etapas se puede incrementar la productividad del proceso <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref18">18</xref>]</sup>
</bold>. En el reporte realizado no se estimó en qué medida podrían lograrse las mejoras. Resulta interesante que no se han encontrado reportes previos de diseños de BSCTA operando con flujos constantes pero diferentes en dos etapas. Este proceso es práctico para su inserción en la práctica industrial y no necesitaría cambios en las instalaciones existentes, solo en las variables operativas.</p>
<p>El presente trabajo tiene como objetivo diseñar por técnicas de diseño <italic>in silico</italic>la operación de un BSCTA en dos etapas para el cultivo de células de mamíferos, tomando un caso de estudio previamente reportado <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref13">13</xref>,<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref14">14</xref>]</sup>
</bold>.</p>
</sec>
<sec>
<title>
<bold>Materiales y métodos</bold>
</title>
<sec>
<title>
<bold>
<italic>Sistemas de cultivo de células</italic>
</bold>
</title>
<p>Se trabaja con un BSCTA con perfil de flujo constante en dos variantes. La variante I es de una sola etapa y es bien conocida. Al tanque se alimenta un flujo constante durante todo el proceso hasta que se llena el volumen efectivo, luego de lo cual se realiza la cosecha del producto. En la variante II el volumen efectivo del biorreactor se divide en dos partes y se aplica una política de alimentación para la primera parte con el fin de maximizar la producción de biomasa, tal como se desprende de<bold>
<sup> [<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref18">18</xref>]</sup>
</bold>. Para la otra, cambia la política de alimentación y se persigue maximizar la producción de la proteína. El diseño persigue como objetivo establecer los flujos óptimos para alcanzar la meta de cada etapa.</p>
</sec>
<sec>
<title>
<bold>
<italic>Caso de estudio utilizado</italic>
</bold>
</title>
<p>Se trata del reportado por<bold>
<sup> [<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref14">14</xref>]</sup>
</bold>, relacionado con una célula de hibridoma productora de un anticuerpo en producción a escala industrial. Es el mismo proceso analizado en <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref18">18</xref>]</sup>
</bold>.</p>
<sec>
<title>
<bold>Modelos matemáticos del sistema de cultivo celular en estudio</bold>
</title>
<p>Un balance de masa macroscópico fue realizado para representar las diferentes fases de los sistemas de cultivo. El proceso se consideró isotérmico y se asumió mezcla perfecta en el interior del recipiente. No se consideró la ocurrencia de limitación del crecimiento celular por falta de oxígeno. La concentración de algunas especies químicas tales como la glucosa (GLC), la glutamina (GLN), el lactato (LAC) y el amoniaco (AMN) se incluyeron en los balances de masas. Además, también se tuvieron en cuenta las concentraciones de células viables y muertas, así como la concentración del AcM.</p>
<p>El modelo matemático que representa las ecuaciones de la <xref ref-type="disp-formula" rid="e1">(1)</xref> a la <xref ref-type="disp-formula" rid="e7">(7)</xref> son válidas para ambas variantes.</p>
<p>
<disp-formula id="e1">
<label>(1)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee2.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>
<disp-formula id="e2">
<label>(2)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee3.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>
<disp-formula id="e3">
<label>(3)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee4.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>
<disp-formula id="e4">
<label>(4)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee5.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>
<disp-formula id="e5">
<label>(5)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee6.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>
<disp-formula id="e6">
<label>(6)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee7.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>
<disp-formula id="e7">
<label>(7)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee8.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>El modelo cinético y sus parámetros fueron tomados del caso en estudio antes definido, pero sus ecuaciones de velocidad fueron tomadas en la forma que se reportó por <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref18">18</xref>]</sup>
</bold>.</p>
</sec>
</sec>
<sec>
<title>
<bold>
<italic>Definición del modelo de optimización</italic>
</bold>
</title>
<p>Se realizó una optimización de ambas variantes, simple etapa y doble etapa, antes de comparar los sistemas de cultivo celular (SCC) estudiados.</p>
<sec>
<title>
<bold>Función objetivo</bold>
</title>
<p>Para el sistema de simple etapa se tomó la productividad anual de AcM (<xref ref-type="disp-formula" rid="e9">ecuación 9</xref>) como criterio de efectividad. La optimización de la segunda variante se realizó de acuerdo con la tesis planteada en el trabajo precedente <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref18">18</xref>]</sup>
</bold>, según la cual, primero debe hacerse crecer la biomasa y luego hacer que ésta produzca el AcM. Así pues, en la primera etapa se optimizó en función de maximizar la productividad en biomasa (<xref ref-type="disp-formula" rid="e8">ecuación 8</xref>), mientras que en la segunda se hizo en función de  maximizar la  productividad  del AcM (<xref ref-type="disp-formula" rid="e9">ecuación 9</xref>).</p>
<p>La expresión para el cálculo de la productividad para estos SCC se definió como:</p>
<p>
<disp-formula id="e8">
<label>(8)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee9.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>
<disp-formula id="e9">
<label>(9)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee10.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>La masa de AcM producida por año de trabajo fue calculada como:</p>
<p>
<disp-formula id="e10">
<label>(10)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee11.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>El término <bold>ɳ<sub>gf</sub>
</bold>incluye la eficiencia global de fermentación y los pasos de recobrado empleados en la producción del AcM. Este parámetro fue estimado en 0,85 considerando la producción promedio de una proteína de una planta industrial de referencia <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref12">12</xref>]</sup>
</bold>.</p>
<p>El número ciclos productivos anuales fue calculado como:</p>
<p>
<disp-formula id="e11">
<label>(11)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee12.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>El fondo de tiempo anual disponible   fue fijado en 7 920 horas, mientras que   el tiempo de fermentación de un ciclo fue calculado como la suma del tiempo de preparación y el de fermentación:</p>
<p>
<disp-formula id="e12">
<label>(12)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee13.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
</sec>
<sec>
<title>
<bold>Selección de las variables de diseño</bold>
</title>
<p>Para la variante I se seleccionaron como variables de diseño la velocidad de dilución estática (D<sub>E</sub>) y la concentración de glucosa en el alimentado (C<sub>GA</sub>). La D<sub>E</sub>, para el perfil de flujo constante se calculó con el volumen total efectivo a llenar (V<sub>T</sub>), según la ecuación <xref ref-type="disp-formula" rid="e13">(13)</xref>.</p>
<p>
<disp-formula id="e13">
<label>(13)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee14.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>La D<sub>E</sub> es constante, lo cual permite calcular el flujo volumétrico de alimentación (F) para un valor fijo del volumen. La velocidad de dilución dinámica (D<sub>D</sub>), sin embargo, es utilizada en el modelo matemático de este sistema y varía en la medida en que se va llenando el biorreactor.</p>
<p>
<disp-formula id="e14">
<label>(14)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee15.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>La concentración de glucosa en el alimentado se varió según el rango utilizado por Kiparissides, entre 10 y 500 mM <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref14">14</xref>]</sup>
</bold>. Esta variable tiene gran influencia en los perfiles de concentración que se imponen en el sistema, al igual que la velocidad de dilución estática.</p>
<p>Para la variante II se estudió el efecto de la D<sub>E</sub> para cada etapa (<xref ref-type="disp-formula" rid="e13">ecuación 13</xref>), de la fracción de volumen de la primera etapa (f<sub>V</sub>) y de la concentración de glucosa en la alimentación. El rango para el estudio de la glucosa fue el mismo que en la variante anterior. El factor f<sub>V</sub> representa la parte del volumen total efectivo que es dedicado a la primera etapa, ecuación <xref ref-type="disp-formula" rid="e15">(15)</xref>.</p>
<p>
<disp-formula id="e15">
<label>(15)</label>
<graphic xlink:href="445552858012_ee16.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</disp-formula>
</p>
<p>El término f<sub>V</sub> representa una variable nueva en el diseño de estos sistemas. No hay referencias de cuál debe ser su valor, pero como la fracción está entre cero y uno, se estudió en ese intervalo. Mientras mayor sea f<sub>V</sub>, mayor será la cantidad de biomasa que almacene la primera etapa y la síntesis de AcM en la segunda <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref18">18</xref>]</sup>
</bold>.</p>
<p>No se consideran otras variables de diseño como la velocidad de agitación, la concentración de sustratos o la temperatura, porque este es un modelo simplificado en el que no se consideran los efectos no isotérmicos, la transferencia y consumo de oxígeno, ni las cuestiones relacionadas con el costo de producción. El trabajo se enfoca más en las variables principales del sistema relacionadas con la productividad y su único objetivo es demostrar la tesis antes planteada<bold>
<sup> [<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref18">18</xref>]</sup>
</bold>.</p>
</sec>
<sec>
<title>
<bold>Parámetros invariables del sistema</bold>
</title>
<p>Los parámetros del sistema fueron fijados en el mismo nivel para ambas variantes. El volumen total del fermentador es de 2000 L. El volumen de la etapa discontinua (arrancada) se definió igual a 1/3 del volumen total efectivo. Para la variante I, este volumen de arrancada se tomó como 1/3 del volumen efectivo de la primera etapa.</p>
<p>La concentración inicial de glucosa de 3 mM, garantiza que en la etapa discontinua se agote prácticamente toda la glucosa y al comenzar la etapa semicontinua sea menor su concentración. La concentración inicial de glucosa fue determinada por tanteo, a partir de simulaciones previas. La concentración de glutamina en el alimentado fue calculada a partir de la relación glutamina- glucosa, ⁄ , según <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref14">14</xref>]</sup>
</bold>.</p>
</sec>
</sec>
<sec>
<title>
<bold>
<italic>Plataforma de diseño in silico</italic>
</bold>
</title>
<p>El programa <underline>MATLAB</underline> v.7.01 fue usado como plataforma para la simulación- optimización. La solución de las ecuaciones diferenciales ordinarias del modelo se realizó con la herramienta <underline>ode15s</underline>, recomendable para sistemas de ecuaciones diferenciales de escalas temporales variables (del tipo <italic>stiff </italic>en inglés). La optimización fue realizada con la herramienta <italic>
<underline>patternsearch</underline>
</italic>. Esta lleva a cabo un método eficaz de búsqueda directa de la región del óptimo. La programación se realizó según el modelo macroscópico para cada variante y se representaron gráficamente los resultados.</p>
</sec>
</sec>
<sec>
<title>
<bold>Resultados y discusión</bold>
</title>
<p>
<bold>
<italic>Optimización de la operación de la variante de simple etapa (Variante I)</italic>
</bold>
</p>
<sec>
<title/>
<p>Para esta variante se determinó que la máxima productividad en la síntesis de AcM que se alcanza es de 101,45 g año<sup>-1 .-1</sup>, para un valor de D. igual a 0,1355 d<sup>-1</sup> y una C<sub>GA</sub> igual a 88,01 mM, (<xref ref-type="fig" rid="gf1">Fig. 1</xref>). Se observa que en la región cercana al óptimo la sensibilidad para ambas variables es significativa. Las condiciones óptimas referidas para este caso permitirán comparar este sistema de cultivo con el de doble etapa.</p>
<p>
<fig id="gf1">
<label>
<bold>Fig. 1</bold>
</label>
<caption>
<title>
<bold>Dependencia de la productividad de AcM con la D<sub>E</sub> y la concentración de glucosa en el alimentado. </bold>
</title>
</caption>
<alt-text>Fig. 1 Dependencia de la productividad de AcM con la DE y la concentración de glucosa en el alimentado.</alt-text>
<graphic xlink:href="445552858012_gf2.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</fig>
</p>
<p>La concentración de células en estas condiciones alcanza un valor máximo de 1,4·10. células/mL (<xref ref-type="fig" rid="gf2">Fig. 2</xref>). Las fechas rojas indican la terminación de las etapas de propagación discontinua y fed-batch. La concentración celular alcanzada es baja, algo que puede estar asociado a la baja concentración del substrato limitante en el alimentado (88,01 mM).</p>
<p>La concentración máxima de AcM al final del proceso (<xref ref-type="fig" rid="gf2">Fig. 2</xref>), muestra valores cercanos a 2,5 g/L, muy alto si se tiene en cuenta la baja concentración de biomasa  lograda.  Al comprar estos  resultados   con lo   reportado   <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref14">14</xref>]</sup>
</bold>, (1,2 g/L), se observa que son superiores en algo más que el doble, sin embargo, la concentración específica de AcM es semejante. Estos resultados son mejores que los reportados por el autor del modelo cinético <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref14">14</xref>]</sup>
</bold>, dado que en este trabajo se optimizaron más variables de diseño.</p>
<p>La dinámica del consumo de glucosa muestra, tal como se había dicho antes, que al terminar la etapa de arrancada, casi se agota este sustrato. Por otra parte, al comenzar la etapa semicontinua se comienzan a acumular los nutrientes, quedando al final de la fermentación una acumulación de glucosa de 10 mM y de glutamina de 3 mM.</p>
<p>
<fig id="gf2">
<label>
<bold>Fig. 2</bold>
</label>
<caption>
<title>
<bold>Dinámica del cultivo semicontinuo de una sola etapa (Variante I). </bold>
</title>
</caption>
<alt-text>Fig. 2 Dinámica del cultivo semicontinuo de una sola etapa (Variante I).</alt-text>
<graphic xlink:href="445552858012_gf3.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</fig>
</p>
<p>La concentración máxima de lactato está en el orden de 70 mM, lo que sobrepasa los niveles nocivos para la célula, según estudios realizados <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref15">15</xref>]</sup>
</bold>. Se ha demostrado que los efectos negativos del lactato se intensifican para valores superiores a 40 mM. El efecto negativo del amonio es observado desde niveles mucho más bajos de concentración, típicamente 2-4 mM, <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref15">15</xref>]</sup>
</bold>. En las condiciones óptimas encontradas para esta variante I y a flujo constante, estas concentraciones permanece por encima de los límites permisibles.</p>
<p>Todo esto indica que el proceso optimizado, aunque con buenos resultados, posee limitaciones que de resolverse le otorgarían mayor potencial. Quizás una estrategia de alimentación con flujo variable sea más apropiada pero está fuera del alcance de este trabajo, enfocado más en hallar evidencias de lo que pudiera aportar un cultivo en dos etapas con objetivos diferentes, tesis planteada en trabajo precedente <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref18">18</xref>]</sup>
</bold>.</p>
</sec>
<sec>
<title>
<bold>
<italic>Optimización de la operación de la variante de dos etapas (Variante II)</italic>
</bold>
</title>
<p>En el caso de la variante de dos etapas, una variable muy importante es la fracción del volumen total del fermentador que sería destinada a cada etapa.  Es por eso que se realizó el diseño óptimo de la operación variando la fracción de volumen de la primera etapa en el rango de 0 a 1. La <xref ref-type="fig" rid="gf3">Fig. 3</xref> evidencia que en la mayor parte de su intervalo, el aumento de esta variable produce una dependencia monótona creciente en la productividad. En los extremos, sin embargo, la productividad decrece bruscamente, sobre todo en el extremo superior. Este resultado resultó inicialmente sorprendente.</p>
<p>
<fig id="gf3">
<label>
<bold>Fig. 3</bold>
</label>
<caption>
<title>
<bold>Dependencia de la productividad anual con la fracción de volumen (Variante II). </bold>
</title>
</caption>
<alt-text>Fig. 3 Dependencia de la productividad anual con la fracción de volumen (Variante II).</alt-text>
<graphic xlink:href="445552858012_gf4.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</fig>
</p>
<p>En busca de evidencias para explicar este comportamiento fue construida la <xref ref-type="fig" rid="gf4">Fig. 4</xref>, que contiene los perfiles de concentración de las diferentes variables para una f<sub>V</sub> igual a la unidad. Esto quiere decir que la primera etapa fue fed- batch y que la segunda etapa fue discontinua (batch), o sea, no se alimentan nutrientes. Este sería un caso extremo, próximo al estado en el que ocurre la inflexión en los extremos de la <xref ref-type="fig" rid="gf3">Fig. 3</xref>, cuando f<sub>V</sub> es casi la unidad. Nótese en la <xref ref-type="fig" rid="gf3">Fig. 3</xref> cómo, al comenzar la segunda etapa, las concentraciones de glucosa y glutamina caen bruscamente. En estas condiciones la concentración de biomasa viable es cercana a 1,2 x 10<sup>6</sup> células/mL, lo que produce una demanda de nutrientes que no se puede satisfacer ante una baja disponibilidad de nutrientes en el tiempo restante. De aquí que los resultados en el extremo derecho de la <xref ref-type="fig" rid="gf3">Fig. 3</xref> se deben al desequilibrio que tal extremo genera entre demanda de nutrientes y su disponibilidad.</p>
<p>En el caso del extremo inferior izquierdo de la <xref ref-type="fig" rid="gf3">Fig. 3</xref>, la explicación es semejante y viene dada por el efecto de dilución que se logra en la segunda etapa debido al desequilibrio entre la baja demanda de nutrientes basada en la cantidad mínima de células conseguidas en la primera etapa, debido al pequeño volumen de ésta.</p>
<p>
<fig id="gf4">
<label>
<bold>Fig. 4</bold>
</label>
<caption>
<title>
<bold>Dinámica del SCC semicontinuo de dos etapas (f<sub>V</sub> = 1).</bold>
</title>
</caption>
<alt-text>Fig. 4 Dinámica del SCC semicontinuo de dos etapas (fV = 1).</alt-text>
<graphic xlink:href="445552858012_gf5.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</fig>
</p>
<p>Al calcular el aumento relativo de la productividad del cultivo en simple y en doble etapa (<xref ref-type="fig" rid="gf5">Fig.5</xref>) en función de la fracción de volumen f<sub>V</sub>, se observa que para valores menores de 0,53 no se consigue un efecto positivo, o sea, no existe superioridad de la segunda variante.</p>
<p>La pregunta que surge ahora es: ¿cuál sería entonces el nivel óptimo de este factor? El factor socio-económico decide, en última instancia, la decisión que se tome. Hacia el futuro habría que plantearse la solución de este problema teniendo en cuenta la variable costo de producción o alguna otra relacionada con los indicadores de eficiencia de la inversión, si ese fuera el caso.</p>
<p>
<fig id="gf5">
<label>
<bold>Fig.5</bold>
</label>
<caption>
<title>
<bold>Dependencia del incremento de la productividad anual con f<sub>V</sub> (Variante II).</bold>
</title>
</caption>
<alt-text>Fig.5 Dependencia del incremento de la productividad anual con fV (Variante II).</alt-text>
<graphic xlink:href="445552858012_gf6.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</fig>
</p>
<p>La función objetivo utilizada en este trabajo (productividad volumétrica), aunque tiene una estrecha relación con el desempeño económico del proceso, no siempre coincide con el óptimo de costo mínimo. Los autores consideran que la variable f<sub>V</sub> requiere de una función objetivo de costo para una mejor precisión del diseño. Como el alcance de este trabajo solo llega hasta demostrar que hay diferencias entre las variantes de simple y doble etapa, entonces, para los fines de ilustración se escogió un valor de f<sub>V</sub> de 80 %. Este valor garantiza una superioridad en productividad de un 30 % de la variante II respecto a  la variante I, tal como se ilustra en la <xref ref-type="fig" rid="gf5">Fig.5</xref>.</p>
<p>Las condiciones óptimas que se consiguen para f<sub>V</sub>=80% junto con los resultados de la variante de simple etapa se muestran en la <xref ref-type="table" rid="gt1">Tabla 1</xref>. Esta tabla muestra las grandes diferencias en los niveles óptimos de C<sub>GA</sub> entre ambas variantes y entre la primera y segunda etapa de la variante de doble etapa (variante II).</p>
<p>
<table-wrap id="gt1">
<label>Tabla 1</label>
<caption>
<title>
<bold>Resultados de la optimización para la variantes de simple y doble con (f<sub>V</sub>=80%)</bold>
</title>
</caption>
<alt-text>Tabla 1 Resultados de la optimización para la variantes de simple y doble con (fV=80%)</alt-text>
<graphic xlink:href="445552858012_gt2.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</table-wrap>
</p>
<p>Nótese las diferencias en las velocidades de dilución estática de la variante de dos etapas. Estas diferencias se deben a la función objetivo que fue utilizada para diseñarlas. Cuando la función objetivo fue maximizar la productividad de AcM, el valor de D. debe ser 0,13 d<sup>-1</sup>, sin importar el tipo de sistema de contacto. Sin embargo, cuando el objetivo es maximizar la productividad en biomasa, D<sub>E</sub> debe ser de 0,5 d<sup>-1</sup>. Este resultado coincide con las predicciones realizadas por los autores en el trabajo anterior <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref18">18</xref>]</sup>
</bold>: altas velocidades de dilución favorecen la formación de biomasa y bajas favorecerán la producción del AcM.</p>
<p>La<xref ref-type="fig" rid="gf6"> Fig. 6</xref> evidencia que en la región cercana al óptimo existe poca sensibilidad de la productividad cuando cambian los valores de las variables estudiadas. Se comporta como si apareciera una saturación del proceso que no produce inhibición, pero que tampoco permite mejorar el desempeño del proceso. Este comportamiento sería muy interesante desde el punto de vista del costo de operación, pues tendería a producir un mínimo a partir del máximo de productividad alcanzado.</p>
<p>
<fig id="gf6">
<label>
<bold>Fig. 6 </bold>
</label>
<caption>
<title>
<bold>Dependencia de la productividad de AcM con la velocidad de dilución estática y la concentración de glucosa en la alimentación (variante II). </bold>
</title>
</caption>
<alt-text>Fig. 6  Dependencia de la productividad de AcM con la velocidad de dilución estática y la concentración de glucosa en la alimentación (variante II).</alt-text>
<graphic xlink:href="445552858012_gf7.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</fig>
</p>
<p>Los resultados de la simulación del comportamiento de la dinámica del sistema en dos etapas, en las condiciones óptimas (<xref ref-type="table" rid="gt1">Tabla 1</xref>), para una fv de 0,8 (<xref ref-type="fig" rid="gf7">Fig.  7</xref>), indican que la concentración de células viables alcanza en la primera etapa un valor de células/mL. Esta concentración, aunque aún baja, cuando   se compara con lo alcanzado en la variante de simple etapa resulta superior en un 21,43 %. La concentración del AcM al finalizar el proceso alcanza un nivel de 4,1 g/L. Este valor es un 58 % mayor que el valor máximo alcanzado en la variante de simple etapa, lo que demuestra la mejora lograda con la estrategia de cultivo en doble etapa.</p>
<p>Las concentraciones de glucosa y glutamina se acumulan a más del doble en comparación con la variante de simple etapa, mientras que las de lactato y las de amonio están muy por encima de los rangos reportados en la literatura  como nocivos para el crecimiento celular. Estos resultados indican que el cultivo en doble etapa con flujo constante no resuelve tampoco la acumulación de estas sustancias nocivas para la célula. A pesar de esto se logra una mejoría notable del proceso en cuanto a productividad. Estas condiciones de nocividad no provocan un cambio significativo en la sensibilidad del proceso según se observa en la <xref ref-type="fig" rid="gf6">figura 6</xref>.</p>
</sec>
<sec>
<title>
<bold>
<italic>Análisis comparativo de los parámetros operativos de cada variante</italic>
</bold>
</title>
<p>Según se ha reportado <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref18">18</xref>]</sup>
</bold>, las condiciones que favorecen el aumento de la productividad de AcM son aquellas que garantizan que en la primera etapa sea máxima la velocidad específica de crecimiento para elevar la productividad en biomasa y una segunda etapa que tenga alta la concentración de biomasa y baja velocidad específica de crecimiento.</p>
<p>
<fig id="gf7">
<label>
<bold>Fig. 7</bold>
</label>
<caption>
<title>
<bold>Dinámica para la variante II en condiciones óptimas con un fv de 0,8.</bold>
</title>
</caption>
<alt-text>Fig. 7 Dinámica para la variante II en condiciones óptimas con un fv de 0,8.</alt-text>
<graphic xlink:href="445552858012_gf8.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</fig>
</p>
<p>La <xref ref-type="fig" rid="gf8">Fig. 8</xref> contiene las evidencias que explican las causas de los mejores resultados obtenidos en la optimización y la coincidencia con  lo  antes predicho <bold>
<sup>[<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref15">15</xref>]</sup>
</bold>. En  la variante  II,  la velocidad  específica  de crecimiento  (<xref ref-type="fig" rid="gf8">Fig. 8A</xref>) es superior en su primera etapa, situada entre el tercero y el quinto día, comparada con el sistema de simple etapa (variante I). Esto explica por qué se alcanza una mayor concentración de biomasa en esta primera etapa que la conseguida en todo el sistema de simple etapa.</p>
<p>Al pasar a la segunda fase de la variante II, esta variable cae por debajo de la variante I, produciendo mejores condiciones para producir mayor cantidad de AcM<bold>
<sup> [<xref ref-type="bibr" rid="redalyc_445552858012_ref18">18</xref>]</sup>
</bold>. Estas observaciones se reflejan en la velocidad de producción del AcM (<xref ref-type="fig" rid="gf8">Fig. 8 B</xref>), que pasa a ser superior en la variante de doble etapa sólo al entrar a su última fase. La velocidad específica de muerte celular (<xref ref-type="fig" rid="gf8">Fig. 8 C</xref>) y la velocidad de lisis celular (<xref ref-type="fig" rid="gf8">Fig. 8 D</xref>) confirman la particularidad del escenario productivo creado en la variante II, favorable a una mayor productividad en el AcM. En la primera etapa de la variante II ambas variables están por debajo de la variante I, lo que permite lograr el aumento de biomasa y luego en la segunda etapa, estas variables empeoran respecto a la variante I. Este cambio de escenario tiene como causa que el proceso en esta fase ya no prioriza maximizar la biomasa sino la síntesis de AcM. Los resultados indican que el incremento en productividad conseguido es significativo con una modificación tan simple del proceso, consistente en operar con dos flujos en el cultivo fed- batch.</p>
<p>Queda pendiente para próximos trabajos diseñar el proceso de doble etapa pero en operación continua con perfusión.</p>
<p>
<fig id="gf8">
<label>
<bold>Fig. 8</bold>
</label>
<caption>
<title>
<bold>Factores que explican el aumento de la productividad en dos etapas: Var I se refiere al proceso en simple etapa y Var II se refiere al proceso en doble etapa.</bold>
</title>
</caption>
<alt-text>Fig. 8 Factores que explican el aumento de la productividad en dos etapas: Var I se refiere al proceso en simple etapa y Var II se refiere al proceso en doble etapa.</alt-text>
<graphic xlink:href="445552858012_gf9.png" position="anchor" orientation="portrait"/>
</fig>
</p>
</sec>
</sec>
<sec>
<title>
<bold>Conclusiones</bold>
</title>
<p>
<bold>
<italic>Se demostró que un sistema de cultivo semicontinuo en dos etapas consigue incrementos significativos de la productividad de AcM respecto a uno de simple etapa. Las simulaciones realizadas en estos sistemas de cultivo de volumen variable con alimentación de flujo constante, padecen de la deficiencia de acumular sustancias nocivas en el medio y de mantener altos niveles de los sustratos al finalizar el proceso, algo que incluso empeora para doble etapa. Otros sistemas de cultivo en doble etapa pudieran mitigar estos efectos y así se conseguiría una mejora aún más notable.</italic>
</bold>
</p>
</sec>
</body>
<back>
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<title>
<bold>Bibliografía</bold>
</title>
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<article-title>"Closing the loop in biological systems modeling. From the in silico to the in vitro"</article-title>
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<mixed-citation>15. KOMPALA, D. S.,OZTURK, S. S. "Optimization of high cell density perfusion bioreactors". Cell Culture Technology for Pharmaceutical and Cell- based.United States of America:Taylor &amp; Francis Group, 2006. p. 387-416.</mixed-citation>
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<surname>OZTURK</surname>
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<source>"Optimization of high cell density perfusion bioreactors". Cell Culture Technology for Pharmaceutical and Cell- based.</source>
<year>2006</year>
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<surname>LAM</surname>
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<source>18th European Symposium on Computer Aided Process Engineering-ESCAPE 18</source>
<year>2008</year>
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<article-title>"Bioprocess engineering aspects of heterologous protein production in Pichia pastoris: A review"</article-title>
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<article-title>"Use of selectivity factor on cell-culture systems conceptual design"</article-title>
<source>Biotecnología Aplicada.</source>
<year>2016</year>
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<article-title>"A genetic redox sensor for mammalian cells"</article-title>
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<year>2006</year>
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<mixed-citation>20. ZADEH, K. "A synergic simulation-optimization approach for analyzing biomolecular dynamics in living organisms". <italic>Computers in Biology and Medicine</italic>. 2011,Vol.41, p. 24-36.</mixed-citation>
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<article-title>"A synergic simulation-optimization approach for analyzing biomolecular dynamics in living organisms"</article-title>
<source>Computers in Biology and Medicine.</source>
<year>2011</year>
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<title>Apéndice</title>
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<italic>Nomenclatura</italic>
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<p>µd- Velocidad específica de células muertas (h-1)</p>
<p>µmáx- Velocidad específica de crecimiento máxima (h-1)</p>
<p>µX- Velocidad específica de crecimiento (h-1)</p>
<p>AcM- Concentración de anticuerpo monoclonal (mg/L) AcMf- Concentración de anticuerpo monoclonal final (mg/L) AMN- Concentración de amonio (mM)</p>
<p>DD- Velocidad de dilución dinámica (d-1) DE- Velocidad de dilución estática (d-1) GLC- Concentración de glucosa (mM) GLN- Concentración de glutamina (mM)</p>
<p>GLCf- Concentración de glucosa en el alimentado (mM) GLNf- Concentración de glutamina en el alimentado (mM) LAC- Concentración de lactato (mM)</p>
<p>nca- Números de ciclos anuales</p>
<p>Pa- Productividad anual de anticuerpo monoclonal (mg/año L) PXV- Productividad anual en biomasa (células /año L)</p>
<p>rAcM- Velocidad de producción de anticuerpo monoclonal (mM/h) rAMN- -Velocidad de producción de amonio (mM/h)</p>
<p>rGLC- Velocidad total de consumo de glucosa (mM/h)</p>
<p>rGLN- Velocidad total de consumo de glutamina (mM/h) rLAC- Velocidad de producción de lactato (mM/h)</p>
<p>rXd- Velocidad de síntesis de células muertas (mM/h)</p>
<p>rXLYZ- Velocidad de lisis de las células muertas (células.106/mL h) rXV- velocidad de síntesis de células viables (mM/h)</p>
<p>Xd-Concentración de células muertas (células/mL) Xv- Concentración de células viables (células/mL)</p>
<p>Xvf- Concentración de células viables final (células/mL)</p>
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