La selección genética realizada en el cerdo durante las últimas décadas ha estado enfocada a obtener animales magros. Un ejemplo claro del éxito de este proceso es la reducción de los índices de conversión desde valores de 4.3, e incluso superiores, en los años sesenta a valores inferiores a 2.2 en la actualidad en las razas más eficientes como la Piétrain (1). En este proceso se ha utilizado el espesor de tocino dorsal (BT) como criterio de selección. La reducción en el BT ha sido espectacular. Los valores que presentan actualmente las razas más seleccionadas se encuentran en el límite inferior fisiológico. Esta reducción en BT ha venido acompañada de una disminución en el contenido de grasa intramuscular (IMF). Como consecuencia de este descenso en IMF se han visto afectados negativamente algunos caracteres de calidad de la carne como la jugosidad, el sabor o la capacidad de retención de agua (2,3). Los cerdos actuales son máquinas biológicas muy eficientes en la conversión de alimento en carne pero producen carnes de baja calidad sensorial.

Para contrarrestar esta tendencia, en algunos países industrializados de Europa se ha utilizado otra estrategia diferente: el uso de razas autóctonas no sometidas a selección para obtener productos cárnicos de alta calidad dirigidos a los mercados de productos de alta gama (4). El paradigma del éxito de esta estrategia es la raza ibérica, cuyos productos curados alcanzan precios muy elevados (un solo jamón curado de las marcas más prestigiosas puede llegar a costar hasta u$ 788$).

Los caracteres complejos, como IMF, son resultado de los efectos producidos por multitud de genes menores. Sin embargo, también existen algunos genes cuyos efectos sobre este carácter son especialmente pronunciados. Estos genes, denominados genes mayores, pueden emplearse para potenciar los fenotipos deseados. Los genes mayores conocidos implicados en la determinación del contenido graso (tanto IMF como BT) son escasos. Algunos de los mejor conocidos son RYR1, el gen del halotano, IGF2, factor de crecimiento de insulina2 (5), MC4R, receptor de melanocortina 4 (6), o PRKAG3, una subunidad reguladora de la proteína quinasa activada por AMP (7).

Recientemente fue descubierto un SNP en la PEPCK-C; la fosfoenolpiruvato carboxiquinasa citosólica, con notables efectos sobre BT e IMF y que van, además, en sentido opuesto (1). Estos marcadores pueden resultar muy útiles para varios fines: por un lado para investigar la historia de la selección llevada a cabo en una raza o para asignar individuos a una determinada raza y, por otro lado, para introgresarlos (en el caso de que ya estén presentes) en razas no seleccionadas para mejorar, principalmente, los caracteres productivos.

El cerdo Pampa Rocha es un cerdo criollo de Uruguay en cuyos orígenes se encuentran los introducidos por los colonizadores españoles y portugueses. Estos cerdos ya habían sido cruzados con poblaciones asiáticas introducidas unos cuantos siglos atrás para mejorar principalmente caracteres maternales como la prolificidad y posteriormente, los cerdos Pampa Rocha se cruzaron con las razas Berkshire y Poland China (8).

Las hembras Pampa Rocha presentan caracteres maternales y de capacidad de pastoreo muy favorables. Su cruce con machos Duroc produce una descendencia con unos parámetros de crecimiento y ganancia de peso mejorados. Los machos Duroc también se cruzan con hembras ibéricas para producir una mejora de los caracteres productivos (9). Los productos curados obtenidos a partir de cerdos de este cruce se encuentran entre los mejores productos ibéricos, siempre y cuando la línea Duroc utilizada no sea magra.

El objetivo del presente trabajo fue investigar la presencia de alelos asociados a la selección en cerdos Pampa Rocha. Las mutaciones IGF2 (5), MC4R (6), PRKAG3 (7) y PEPCK (1) fueron analizadas por diversos métodos y también fueron estudiadas en jabalís, cerdos Piétrain y algunas razas o líneas de cerdos autóctonas de España y Portugal. Finalmente se evaluó la utilidad de dicho análisis para mejorar el valor comercial de los cerdos de la raza Pampa Rocha.

Material animal. Las muestras de músculo congelado de jabalí nos las proporcionaron algunos amigos cazadores de nuestro Departamento. Las muestras de músculo congelado de los cerdos ibéricos analizados procedían de la cooperativa ganadera COVAP (Pozoblanco, España) y del CENSYRA (Badajoz, España). El Dr. Carballo García (Universidad de Vigo, España) nos suministró las muestras de músculo congelado de los cerdos Porco Celta, así como las de pelo de los Bízaro. Las muestras de pelo de los cerdos Pampa Rocha se obtuvieron de animales pertenecientes a la Unidad de Producción de Cerdos del Centro Regional Sur-Facultad de Agronomía (Universidad de la República) situada en Progreso, Departamento de Canelones, Uruguay. La empresa Agropecuaria OBANOS S.A. (Marcilla, España) nos proporcionó el semen de los cerdos Piétrain analizados.

Extracción de DNA. El DNA se extrajo de músculo, semen o de folículos pilosos utilizando el kit RealPure Genomic DNA Extraction de Durviz (Valencia, España) o el kit GenomicPrep^TM DNA isolation de Amersham Biosciences (Little Chalfont, Reino Unido), de acuerdo con las instrucciones del fabricante. La concentración de DNA en el extracto se determinó utilizando un espectrofotómetro NanoDrop 1000 (Thermo Fischer Scientific, Wilmington, DE, EEUU).

Genotipado. El análisis del genotipo de IGF2, MC4R, PRKAG3 y PEPCK-C se llevó a cabo por PCR a tiempo real tal y como se describe en Burgos et al (10), Burgos et al (11), Galve et al (12) y Latorre et al (1) respectivamente.

En la tabla 1 se muestra el resultado de los análisis del genotipo de IGF2 de los cerdos Pampa Rocha y de las razas autóctonas de España y Portugal. El alelo G es el alelo salvaje. El alelo A representa en la población de Piétrain el 99% de los alelos totales. Por el contrario, los cerdos Pampa Rocha son casi todos homocigotos GG. Tan solo uno de los animales es heterocigoto. En este sentido, los jabalís, las razas y líneas de cerdos españoles y los cerdos portugueses Bízaro son muy similares a los Pampa Rocha: los cerdos Porco Celta y los cerdos de las dos líneas ibéricas analizadas son todos homocigotos GG y tan solo dos cerdos Bízaro son heterocigotos, siendo el resto de ellos homocigotos GG.

Tabla 1 Tabla 1 Genotipos y frecuencias alélicas de IGF2 de todos los animales analizados.

	Genotipos IGF2			Frecuencias alélicas
	GG	AG	AA	G	A
Jabalí	6	0	0	1.000	0.000
Ibérico
Andalucía	25	0	0	1.000	0.000
Extremadura	24	0	0	1.000	0.000
Porco Celta	35	0	0	1.000	0.000
Bízaro	50	2	0	0.981	0.019
Pampa Rocha	59	1	0	0.992	0.008
Piétrain	0	1	97	0.005	0.995

El resultado del análisis del genotipo de MC4R aparece recogido en la tabla 2. No resulta para nada sorprendente que el alelo A esté prácticamente fijado en los cerdos Piétrain, una raza caracterizada por una baja ingesta de alimento (13). Sí resulta curioso, por el contrario, que los jabalís también presenten este mismo genotipo. Esto mismo sucede con todas las razas de la península ibérica, a pesar de que en todos los casos la presencia de alelos A dista mucho de ser insignificante. Los genotipos MC4R de los cerdos Pampa Rocha difieren considerablemente de los de todas estas razas y líneas ya que en ellos los alelos más abundantes son los alelos A.

Tabla 2 Tabla 2 Genotipos y frecuencias alélicas de MC4R de todos los animales analizados.

	Genotipos MC4R			Frecuencias alélicas
	GG	AG	AA	G	A
Jabalí	6	0	0	1.000	0.000
Ibérico
Andalucía	23	2	0	0.960	0.040
Extremadura	20	4	0	0.917	0.083
Porco Celta	33	2	0	0.971	0.029
Bízaro	39	13	0	0.875	0.125
Pampa Rocha	8	32	21	0.393	0.607
Piétrain	91	7	0	0.964	0.036

En la tabla 3 se muestran los genotipos PRKAG3. El alelo presumiblemente salvaje, el alelo G, es el predominante (97%) en los jabalís. Las líneas ibéricas tienen mayoritariamente alelos A (90-100%). Los cerdos Pampa Rocha y Porco Celta tienen ligeramente más alelos A (61 % aproximadamente) que G (39% aproximadamente). Los cerdos Piétrain y Bízaro tienen, sin embargo, ligeramente más alelos G que alelos A.

Por último, en la tabla 4 se muestran los genotipos PEPCK-C. En esta tabla no están incluidos los cerdos Bízaro y Porco Celta porque, lamentablemente, cuando descubrimos este SNP (1) no teníamos disponible DNA de cerdos de estas razas. En todas las razas y líneas no seleccionadas por contenido magro, incluida la Pampa Rocha, predomina el alelo A. En el extremo opuesto se encuentran los cerdos Piétrain, con más alelos C que alelos A.

Tabla 3 Tabla 3 Genotipos y frecuencias alélicas de PRKAG3 de todos los animales analizados.

	Genotipos PRKAG3			Frecuencias alélicas
	GG	AG	AA	G	A
Jabalí	15	1	0	0.969	0.031
Ibérico
Andalucía	0	5	20	0.100	0.900
Extremadura	0	0	11	0.000	1.000
Porco Celta	7	13	15	0.386	0.614
Bízaro	9	21	2	0.609	0.391
Pampa Rocha	3	9	7	0.395	0.605
Piétrain	8	7	1	0.719	0.281

Tabla 4 Tabla 4 Genotipos y frecuencias alélicas de PEPCK-c de todos los animales analizados.

	Genotipos PEPCK-C			Frecuencias alélicas
	CC	AC	AA	C	A
Jabalí	0	3	10	0.115	0.885
Ibérico
Andalucía	0	8	9	0.235	0.765
Extremadura	0	0	9	0.000	1.000
Pampa Rocha	1	8	30	0.128	0.872
Piétrain	21	26	2	0.694	0.306

El alelo A de IGF2, originado en cerdos asiáticos, es responsable del 10-20% de la variabilidad fenotípica en los caracteres grasos (5). Se trata, por lo tanto, de un SNP de gran relevancia dados sus enormes efectos fenotípicos sobre caracteres morfológicos y productivos importantes (10, 14). Es uno de los pocos marcadores que puede utilizarse por sí mismo como criterio de selección. Su uso en Pampa Rocha está limitado por la práctica ausencia de alelos A. Los alelos A están asociados tanto a valores reducidos en el espesor de tocino dorsal como a contenidos de IMF elevados. Si se pretendiese implementar un esquema productivo consistente en cruzar hembras Pampa Rocha (mayoritariamente GG) con machos Duroc AA, el status actual de IGF2 en los cerdos Pampa Rocha podría resultar muy adecuado. Esto es así dado que el locus de IGF2 se encuentra sujeto a imprinting (15); tan solo se expresan en la descendencia los genes recibidos por vía paterna, haciendo que el alelo materno resulte irrelevante para la F1. Sin embargo, este alelo G tiene una gran importancia para los caracteres maternales; de hecho, el genotipo GG en las hembras da lugar a 0.5-1 lechones más en cada parto (16).

Este hecho es consecuencia del enorme efecto de engrasamiento que produce el alelo G y de la conocida relación existente entre un adecuado engrasamiento de las hembras y una mayor capacidad de producción de leche, como consecuencia de lo cual se produce un aumento el número de lechones vivos en la descendencia.

MC4R codifica un receptor implicado en los circuitos neuronales que regulan la ingesta de alimento (17,18). El alelo A está asociado a un incremento de la ingesta de alimento y, como consecuencia de ello, a un incremento en BT y en la velocidad de crecimiento (6, 19, 20). Utilizando este SNP como criterio de selección puede dirigirse ésta en cerdos Pampa Rocha para favorecer el engrasamiento (alelos A) o las carnes magras (alelos G). Como los cerdos Pampa Rocha ya presentan un nivel de engrasamiento suficientemente elevado, pensamos que podría ser recomendable seleccionar animales con el genotipo GG para mejorar los caracteres productivos de esta raza.

El mecanismo por el que el SNP en este gen descrito por Ciobanu et al (7) tiene efectos sobre los caracteres grasos no ha sido todavía elucidado. PRKAG3 codifica una subunidad reguladora de la proteína quinasa activada por AMP, que se encuentra implicada en la determinación del contenido en glucógeno del músculo estriado y, como consecuencia de ello, en el pH final de la carne. El alelo A se encuentra asociado a valores elevados de BT (12, 21). La selección de alelos A o G es una decisión complicada ya que afecta a distintos caracteres fenotípicos de una manera compleja. Sin embargo, la presencia prácticamente equilibrada de alelos G y A de este SNP hace que su selección en Pampa Rocha resulte un proceso sencillo.

Por último, el alelo A es el alelo asociado a un mayor contenido de grasa intramuscular, a un menor BT y a una exudación más baja (1), un fenotipo extraordinariamente valioso y poco común para la producción de carne de gran calidad. Esto significa que la carne de los cerdos Pampa Rocha podría mejorarse eliminando de los esquemas reproductivos los pocos animales que contienen alelos C.

El escaso número de muestras analizadas no nos permite realizar un estudio de haplotipos combinando los cuatro genes analizados. En nuestro estudio no hemos considerado un gen mayor extraordinariamente relevante, RYR1, por su implicación en la aparición de carnes PSE (22), aunque es bastante poco probable encontrar variabilidad en este marcador dado que esta mutación se originó presumiblemente en la raza Piétrain.

Los cerdos Pampa Rocha presentan frecuencias alélicas similares a las de las razas autóctonas de la península ibérica para algunos genes asociados a procesos de mejora. Esto es especialmente cierto en el caso de IGF2, cuyo alelo G está fijado en todas las razas o líneas no sometidas a selección artificial, incluida la Pampa Rocha, mientras que, por el contrario, el alelo A está prácticamente fijado en los cerdos Piétrain, el paradigma de muscularidad. Las frecuencias alélicas para el marcador PEPCK-C en todas las razas no seleccionadas presentan un patrón similar a pesar de que existe cierta variabilidad con respecto a este marcador en todas las razas analizadas. Pampa Rocha presenta unas frecuencias alélicas de PRKAG3 bastante semejantes a la de los cerdos de origen céltico, y en especial en el caso de los Porco Celta. Por el contrario, Pampa Rocha difiere de todas las razas autóctonas estudiadas en este trabajo en cuanto a las frecuencias alélicas del marcador MC4R, lo que demuestra la singularidad de esta raza derivada probablemente de su diferente historia evolutiva.

Conflicto de intereses

Los autores no declaramos ningún conflicto de intereses.