Normas de Colaboración
Preparación
del manuscrito
El envío
de un manuscrito implica la declaración explícita por parte del autor(es) de
que este no ha sido previamente publicado, ni aceptado para su publicación en
otra revista u otro órgano de difusión científica. Todas las contribuciones son
de la entera responsabilidad de sus autores y no del Instituto de
Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, ni de la revista o
sus editores.
Los
trabajos pueden estar escritos en español, inglés o portugués, y se recomienda
que no excedan las 40 páginas (párrafo espaciado a 1,5 líneas) incluyendo
tablas, figuras y anexos. En casos especiales el editor podrá considerar la
publicación de trabajos más extensos, monografías o actas de congresos,
talleres o simposios. De particular interés para la revista son las
descripciones de especies nuevas para la ciencia, nuevos registros geográficos
y listados de la biodiversidad regional.
Para la
elaboración de los textos del manuscrito se puede usar cualquier procesador de
palabras (preferiblemente Word); los listados (a manera de tabla) deben ser
elaborados en una hoja de cálculo (preferiblemente Excel). Para someter un
manuscrito es necesario además anexar una carta de intención en la que se
indique claramente:
1.
Nombre(s) completo(s) del(los) autor(es), y direcciones para envío de
correspondencia (es indispensable suministrar una dirección de correo
electrónico para comunicación directa).
2. Título
completo del manuscrito.
3.
Nombres, tamaños y tipos de archivos suministrados.
4. Lista
mínimo de tres revisores sugeridos que puedan evaluar el manuscrito, con sus
respectivas direcciones electrónicas.
Evaluación del manuscrito
Los manuscritos sometidos serán
revisados por pares científicos calificados, cuya respuesta final de
evaluación puede ser: a) aceptado (en cuyo caso se asume que no existe
ningún cambio, omisión o adición al artículo, y que se recomienda su
publicación en la forma actualmente presentada); b) aceptación condicional (se
acepta y recomienda el artículo para su publicación solo si se realizan los
cambios indicados por el evaluador); y c) rechazo (cuando el evaluador
considera que los contenidos o forma de presentación del artículo no se ajustan
a los requerimientos y estándares de calidad de Biota Colombiana).
Texto
- Para la
presentación del manuscrito configure las páginas de la siguiente manera: hoja
tamaño carta, márgenes de 2,5 cm en todos los lados, interlineado 1,5 y
alineación hacia la izquierda (incluyendo título y bibliografía).
- Todas las páginas de texto (a excepción de la primera
correspondiente al título), deben numerarse en la parte inferior derecha de la
hoja.
- Use letra Times
New Roman o Arial, tamaño 12 puntos en todos los textos. Máximo 40 páginas,
incluyendo tablas, figuras y anexos. Para tablas cambie el tamaño de la fuente
a 10 puntos. Evite el uso de negritas o subrayados. - Los manuscritos debe
llevar el siguiente orden: título, resumen y palabras clave, abstract y key
words, introducción, material y métodos, resultados, discusión, conclusiones
(optativo), agradecimientos (optativo) y bibliografía. Seguidamente, presente
una página con la lista de tablas, figuras y anexos. Finalmente, incluya las
tablas, figuras y anexos en archivos separadas, debidamente
identificadas. - Escriba los nombres científicos de géneros, especies y
subespecies en cursiva (itálica). Proceda de la misma forma con los términos en
latín (p. e. sensu, et al.). No subraye ninguna otra palabra o título.
No utilice notas al pie de página. - En cuanto a las abreviaturas y sistema
métrico decimal, utilice las normas del Sistema Internacional de Unidades (SI)
recordando que siempre se debe dejar un espacio libre entre el valor numérico y
la unidad de medida (p. e. 16 km, 23 ºC). Para medidas relativas como m/seg.,
use m.seg-1. - Escriba los números del uno al diez siempre con letras, excepto
cuando preceden a una unidad de medida (p. e. 9 cm) o si se utilizan como
marcadores (p. e. parcela 2, muestra 7). - No utilice punto para separar los
millares, millones, etc. Utilice la coma para separar en la cifra la parte
entera de la decimal (p. e. 3,1416). Enumere las horas del día de 0:00 a 24:00.
- Exprese los años con todas las cifras sin demarcadores de miles (p. e.
1996-1998). En español los nombres de los meses y días (enero, julio, sábado,
lunes) siempre se escriben con la primera letra minúscula, no así en inglés. -
Los puntos cardinales (norte, sur, este y oeste) siempre deben ser escritos en
minúscula, a excepción de sus abreviaturas N, S, E, O (en inglés W), etc. La
indicación correcta de coordenadas geográficas es como sigue:
02º37´53´´N-56º28´53´´O. La altitud geográfica se citará como se expresa a
continuación: 1180 m s.n.m. (en inglés 1180 m a.s.l). - Las abreviaturas se
explican únicamente la primera vez que son usadas. - Al citar las referencias
en el texto mencione los apellidos de los autores en caso de que sean uno o
dos, y el apellido del primero seguido por et al. cuando
sean tres o más. Si menciona varias referencias, éstas deben ser ordenadas
cronológicamente y separadas por comas (p. e. Rojas 1978, Bailey et al. 1983,
Sephton 2001, 2001). - Resumen: incluya un resumen de máximo 200 palabras,
tanto en español o portugués como inglés. - Palabras clave: máximo seis
palabras clave, preferiblemente complementarias al título del artículo, en
español e inglés.
Agradecimientos
Opcional.
Párrafo sencillo y conciso entre el texto y la bibliografía. Evite títulos como
Dr., Lic., TSU, etc.
Fotografías,
figuras, tablas y anexos
Refiera
las figuras (gráficas, diagramas, ilustraciones y fotografías) sin abreviación
(p. e. Figura 3) al igual que las tablas (p. e. Tabla 1). Gráficos (p. e. CPUE
anuales) y figuras (histogramas de tallas), preferiblemente en blanco y negro,
con tipo y tamaño de letra uniforme. Deben ser nítidas y de buena calidad,
evitando complejidades innecesarias (por ejemplo, tridimensionalidad en
gráficos de barras); cuando sea posible use solo colores sólidos en lugar de
tramas. Las letras, números o símbolos de las figuras deben ser de un tamaño
adecuado de manera que sean claramente legibles una vez reducidas. Para el caso
de las fotografías y figuras digitales es necesario que estas sean guardadas
como formato tiff con una resolución de 300 dpi. Es oportuno que indique en qué
parte del texto desea insertarla.
Lo mismo
aplica para las tablas y anexos, los cuales deben ser simples en su estructura
(marcos) y estar unificados. Presente las tablas en archivo aparte (Excel),
identificadas con su respectivo número. Haga las llamadas a pie de página de
tabla con letras ubicadas como superíndice. Evite tablas grandes sobrecargadas
de información y líneas divisorias o presentadas en forma compleja. Es oportuno
que indique en qué parte del texto desea insertar tablas y anexos.
Bibliografía
Contiene únicamente la lista de las referencias citadas en el
texto. Ordénelas alfabéticamente por autores y cronológicamente para un mismo
autor. Si hay varias referencias de un mismo autor(es) en el mismo año, añada
las letras a, b, c, etc. No abrevie los nombres de las revistas. Presente las
referencias en el formato anexo, incluyendo el uso de espacios, comas, puntos,
mayúsculas, etc.
Artículo
en revistas
Agosti,
D., C. R. Brandao y S. Diniz. 1999. The new world species of the subfamily
Leptanilloidinae (Hymenoptera: Formicidae). Systematic Entomology 24:
14-20.
Libros, tesis e
informes técnicos
Libros: Gutiérrez,
F. P. 2010. Los recursos hidrobiológicos y pesqueros en Colombia. Instituto de
Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. Bogotá, D. C., 118
pp.
Tesis: Cipamocha,
C. A. 2002. Caracterización de especies y evaluación trófica de la subienda de
peces en el raudal Chorro de Córdoba, bajo río Caquetá, Amazonas, Colombia.
Trabajo de grado. Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias,
Departamento de Biología. Bogotá D. C., 160 pp.
Informes
técnicos: Andrade, G. I. 2010. Gestión del conocimiento para la gestión de la
biodiversidad: bases conceptuales y propuesta programática para la reingeniería
del Instituto Humboldt. Informe Técnico. Instituto de Investigación de Recursos
Biológicos Alexander von Humboldt. Bogotá D. C., 80 pp.
Capítulo
en libro o en informe: Fernández F., E. E. Palacio y W. P. MacKay.
1996. Introducción al estudio de las hormigas (Hymenoptera: Formicidae) de
Colombia. Pp: 349-412. En: Amat, G. D., G. Andrade y F. Fernández
(Eds.). Insectos de Colombia. Estudios Escogidos. Academia Colombiana de Ciencias
Exactas, Físicas y Naturales & Centro Editorial Javeriano, Bogotá.
Resumen
en congreso, simposio, talleres: Señaris, J. C. 2001. Distribución
geográfica y utilización del hábitat de las ranas de cristal (Anura;
Centrolenidae) en Venezuela. En: Programa y Libro de Resúmenes del IV
Congreso Venezolano de Ecología. Mérida, Venezuela, p. 124.
Páginas
Web
No serán incluidas en la bibliografía, sino que se señalarán
claramente en el texto al momento de mencionarlas.
Manuscript
preparation
Submitting
a manuscript implies the explicit statement by the author(s) that the paper has
not been published before nor accepted for publication in another journal or
other means of scientific diffusion. Contributions are entire responsibility of
the author and not the Alexander von Humboldt Institute for Research on
Biological Resources, or the journal and their editors.
Papers can be written in Spanish, English or Portuguese and it is
recommended not exceeding 40 pages (with paragraphs spaced at 1,5) including
tables, figures and Annex. For special cases, the editor could consider
publishing more extensive papers, monographs or symposium conclusions. New
species descriptions for science, new geographic records and regional
biodiversity lists are of particular interest for this journal.
Any word-processor
program may be used for the text (Word is recommended). taxonomic
list or any other type of table, should be prepared in spreadsheet aplication
(Excel is recommended). To submit a manuscript must be accompanied by a cover
letter which clearly indicate s:
1. Full
names, mailing addresses and e-mail addresses of all authors. (Please note that
email addresses are essential to direct communication).
2. The
complete title of the article.
3. Names,
sizes, and types of files provide.
4. A
list of the names and addresses of at least three (3) reviewers who are
qualified to evaluate the manuscript.
Evaluation
Submitted manuscript will have a peer
review evaluation. Resulting in any of the following: a) accepted (in
this case we assume that no change, omission or addition to the article is
required and it will be published as presented.); b) conditional acceptance (the
article is accepted and recommended to be published but it needs to be corrected
as indicated by the reviewer); and c) rejected (when the reviewer
considers that the contents and/or form of the paper are not in accordance with
requirements of publication standards of Biota Colombiana).
Text
- The
manuscript specifications should be the following: standard letter size paper,
with 2.5 cm margins on all sides, 1.5-spaced and left-aligned (including title
and bibliography).
- All
text pages (with the exception of the title page) should be numbered. Pages
should be numbered in the lower right corner.
- Use
Times New Roman or Arial font, size 12, for all texts. Use size 10 text in
tables. Avoid the use of bold or underlining. 40 pages maximum, including
tables, figures and annex. For tables use size 10 Times New Roman or Arial Font
(the one used earlier).
- The
manuscripts must be completed with the following order: title, abstract and key
words, then in Spanish Título, Resumen y Palabras claves. Introduction,
Materials and Methods, Results, Discussion, conclusions (optional), acknowledgements
(optional) and bibliography. Following include a page with the Table, Figure
and Annex list. Finally tables, figures and annex should be presented and
clearly identified in separate tables.
-
Scientific names of genera, species and subspecies should be written in italic.
The same goes for Latin technical terms (i.e sensu, et al.). Avoid the
use of underlining any word or title. Do not use footnotes.
- As for
abbreviations and the metric system, use the standards of the International
System of Units (SI) remembering that there should always be a space between
the numeric value and the measure unit (e.g., 16 km, 23 ºC). For relative
measures such as m/sec, use m.sec-1.
- Write
out numbers between one to ten in letters except when it precedes a measure
unit (e.g., 9 cm) or if it is used as a marker (e.g., lot 9, sample 7).
- Do not
use a point to seperate thousands, millions, etc. Use a comma to separate the
whole part of the decimal (e.g., 3,1416). Numerate the hours of the from 0:00
to 24:00. Express years with all numbers and without marking thousands (e.g.,
1996- 1998). In Spanish, the names of the months and days (enero, julio,
sábado, lunes) are always written with the first letter as a lower case, but it
is not this way in English.
- The
cardinal points (north, south, east, and west) should always be written in
lower case, with the excpetino of abbreviations N, S, E, O (in English NW),
etc. The correct indication of geographic coordinates is as follows:
02º37´53´´N-56º28´53´´O. The geographic altitude should be cited as follows:
1180 m a.s.l.
- Abbreviations are explained only the first time they are used.
- When
quoting references in the text mentioned author´s last names when they are one
or two, and et al. after the last name of the first
author when there are three or more. If you mention many references, they
should be in chronological order and separated by commas (e.g., Rojas 1978,
Bailey et al. 1983, Sephton 2001, 2001).
-
Abstract: include an abstract of 200 words maximum, in Spanish, Portuguese or
English.
- Key words: six key words maximum, complementary to the
title.
Pictures,
Figures, Tables and Annex
- Figures
(graphics, diagrams, illustrations and photographs) without abbreviation (e.g.
Figure 3) the same as tables (e.g., Table 1). Graphics and figures should be in
black and white, with uniform font type and size. They should be sharp and of
good quality, avoiding unnecessary complexities (e.g., three dimensions
graphics). When possible use solid color instead of other schemes. The words,
numbers or symbols of figures should be of an adequate size so they are
readable once reduced. Digital figures must be sent at 300 dpi and in .tiff
format. Please indicate in which part of the text you would like to include it.
- The same applies to tables and annexes, which should be
simple in structure (frames) and be unified. Present tables in a separate file
(Excel), identified with their respective number. Make calls to table footnotes
with superscript letters above. Avoid large tables of information overload and
fault lines or presented in a complex way. It is appropriate to indicate where
in the text to insert tables and annexes.
Bibliography
References
in bibliography contains only the list of references cited in the text. Sort
them alphabetically by authors and chronologically by the same author. If there
are several references by the same author(s) in the same year, add letters a,
b, c, etc. Do not abbreviate journal names. Present references in the attached
format, including the use of spaces, commas, periodss, capital letters, etc.
Journal
article
Agosti,
D., C. R. Brandao y S. Diniz. 1999. The new world species of the subfamily
Leptanilloidinae (Hymenoptera: Formicidae). Systematic Entomology 24:
14-20.
Book,
thesis, technical reviews
Book: Gutiérrez,
F. P. 2010. Los recursos hidrobiológicos y pesqueros en Colombia. Instituto de
Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. Bogotá, D. C. 118
pp.
Thesis: Cipamocha,
C. A. 2002. Caracterización de especies y evaluación trófica de la subienda de
peces en el raudal Chorro de Córdoba, bajo río Caquetá, Amazonas, Colombia.
Trabajo de grado. Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias,
Departamento de Biología. Bogotá D. C. 160 pp.
Technical reviews: Andrade, G. I. 2010. Gestión del
conocimiento para la gestión de la biodiversidad: bases conceptuales y
propuesta programática para la reingeniería del Instituto Humboldt. Informe
Técnico. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von
Humboldt. Bogotá D. C. 80 pp.
Book chapter or in review: Fernández F., E. E. Palacio y W.
P. MacKay. 1996. Introducción al estudio de las hormigas (Hymenoptera:
Formicidae) de Colombia. Pp: 349-412. En: Amat, G. D., G. Andrade y F.
Fernández (Eds.). Insectos de Colombia. Estudios Escogidos. Academia Colombiana
de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales & Centro Editorial Javeriano,
Bogotá.
Symposium
abstract: Señaris, J. C. 2001. Distribución geográfica y utilización del
hábitat de las ranas de cristal (Anura; Centrolenidae) en Venezuela. En: Programa
y Libro de Resúmenes del IV Congreso Venezolano de Ecología. Mérida, Venezuela,
p. 124.
Web pages
Not be included in the literature, but clearly identified in the
text at the time of mention.
El
objetivo de esta guía es establecer y explicar los pasos necesarios para la
elaboración de un manuscrito con el potencial de convertirse en artículo de
datos para ser publicado en la revista Biota Colombiana. En esta guía se
incluyen aspectos relacionados con la preparación de datos y el manuscrito.
¿Qué es
un artículo de datos?
Un
artículo de datos o Data Paper es un tipo de publicación académica que
ha surgido como mecanismo para incentivar la publicación de datos sobre
biodiversidad, a la vez que es un medio para generar reconocimiento académico y
profesional adecuado a todas las personas que intervienen de una manera u otra
en la gestión de información sobre biodiversidad.
Los artículos
de datos contienen las secciones básicas de un artículo científico tradicional.
Sin embargo, estas se estructuran de acuerdo a un estándar internacional para
metadatos (información que le da contexto a los datos) conocido como el GBIF
Metadata Profile (GMP)1. La estructuración del manuscrito
con base en este estándar se da, en primer lugar, para facilitar que la
comunidad de autores que publican conjuntos de datos a nivel global, con
presencia en redes como la Global Biodiversity Information Facility (GBIF)
y otras redes relacionadas, puedan publicar fácilmente artículos de datos
obteniendo el reconocimiento adecuado a su labor. En segundo lugar, para
estimular que los autores de este tipo de conjuntos de datos que aún no han
publicado en estas redes de información global, tengan los estímulos necesarios
para hacerlo.
Un artículo de datos debe describir de la mejor manera posible el
quién, qué, dónde, cuándo, por qué y cómo de la toma y almacenamiento de los
datos, sin llegar a convertirse en el medio para realizar un análisis
exhaustivo de los mismos, como sucede en otro tipo de publicaciones académicas.
Para profundizar en este modelo de publicación se recomienda consultar a Chavan
y Penev (2011)2.
¿Qué
manuscritos pueden llegar a ser artículos de datos?
Manuscritos
que describan conjuntos de datos primarios y originales que contengan registros
biológicos (captura de datos de la presencia de un(os) organismo(s) en un lugar
y tiempo determinados); información asociada a ejemplares de colecciones biológicas;
listados temáticos o geográficos de especies; datos genómicos y todos aquellos
datos que sean susceptibles de ser estructurados con el estándar Darwin Core3 (DwC).
Este estándar es utilizado dentro de la comunidad de autores que publican conjuntos
de datos sobre biodiversidad para estructurar los datos y de esta manera poder
consolidarlos e integrarlos desde diferentes fuentes a nivel global. No se
recomienda someter manuscritos que describan conjuntos de datos secundarios,
como por ejemplo compilaciones de registros biológicos desde fuentes
secundarias (p.e. literatura o compilaciones de registros ya publicados en
redes como GBIF o IABIN).
Preparación
de los datos
Como se mencionó anteriormente los datos sometidos dentro de este
proceso deben ser estructurados en el estándar DwC. Para facilitar su
estructuración, el Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia (SiB
Colombia), ha creado dos plantillas en Excel, una para registros biológicos y
otra para listas de especies. Lea y siga detenidamente las instrucciones de las
plantillas para la estructuración de los datos a publicar. Para cualquier duda
sobre el proceso de estructuración de estos datos por favor contactar al equipo
coordinador del SiB Colombia (EC-SiB) en sib+iac@humboldt.org.co.
Preparación
del manuscrito
Para
facilitar la creación y estructuración del manuscrito en el estándar GMP, se
cuenta con la ayuda de un editor electrónico (http://ipt.sibcolombia.net/biota)
que guiará al autor en dicho proceso y que finalmente generará una primera
versión del manuscrito. Se recomienda el uso del manual GMP, como una guía de
la información a incluir en cada sección del manuscrito, junto con el anexo 1.
Pasos a
seguir para la elaboración del manuscrito:
1
Solicite al correo sib+iac@humboldt.org.co el acceso al editor electrónico. El
EC-SiB le asignará un usuario y contraseña.
2.
Ingrese con su usuario y contraseña al editor electrónico, luego diríjase a la
pestaña Gestión de recursos y cree un nuevo recurso asignando un nombre
corto a su manuscrito usando el formato
“AcrónimoDeLaInstitución_año_tipoDeConjuntoDeDatos”, p.e. ABC_2010_avestinije y
dar clic en el botón crear.
3. En la
vista general del editor seleccione “editar” en la pestaña Metadatos (por
favor, no manipule ningún otro elemento), allí encontrará diferentes secciones
(panel derecho) que lo guiarán en la creación de su manuscrito. Guarde los
cambios al finalizar cada sección, de lo contrario perderá la información.
Recuerde usar el manual GMP. A continuación se presentan algunas
recomendaciones para la construcción del manuscrito. Las secciones se indican
en MAYUSCULAS y los elementos de dichas secciones en negrilla.
• En
PARTES ASOCIADAS incluya únicamente aquellas personas que no haya incluido en
INFORMACIÓN BÁSICA.
• Los
DATOS DEL PROYECTO y DATOS DE LA COLECCIÓN son opcionales según el tipo de
datos. En caso de usar dichas secciones amplíe o complemente información ya
suministrada, p. ej. no repita información de la descripción
(COBERTURA GEOGRÁFICA) en la descripción del área de estudio (DATOS
DEL PROYECTO).
• De
igual manera, en los MÉTODOS DE MUESTREO, debe ampliar o complementar
información, no repetirla. La información del área de estudio debe dar
un contexto específico a la metodología de muestreo.
• Es
indispensable documentar el control de calidad en MÉTODOS DE MUESTREO.
Acá se debe describir que herramientas o protocolos se utilizaron para
garantizar la calidad y coherencia de los datos estructurados con el estándar
DwC.
• Para crear
la referencia del recurso, en la sección REFERENCIAS, utilice uno de los
dos formatos propuestos (Anexo 2). No llene el identificador de la
referencia, este será suministrado posteriormente por el EC-SiB.
• Para
incluir la bibliografía del manuscrito en referencias, ingrese cada una
de las citas de manera individual, añadiendo una nueva referencia cada vez
haciendo clic en la esquina inferior izquierda.
4.
Rectifique que el formato de la información suministrada cumpla con los
lineamientos de la revista (p. ej. abreviaturas, unidades, formato de números
etc.) en la Guía general para autores de Biota Colombiana.
5. Una
vez incluida y verificada toda la información en el editor electrónico
notifique al EC-SiB al correo electrónico sib+iac@ humboldt.org.co, indicando
que ha finalizado la edición del manuscrito. Adicionalmente adjunte la
plantilla de Excel con los datos estructurados (elimine todas las columnas que
no utilizó). El EC-SiB realizará correcciones y recomendaciones finales acerca
de la estructuración de los datos y dará las instrucciones finales para que
usted proceda a someter el artículo.
Someter
el manuscrito
Una vez
haya terminado la edición de su manuscrito y recibido las instrucciones por
parte del EC-SIB, envíe una carta al correo electrónico
biotacol@humboldt.org.co para someter su artículo, siguiendo las instrucciones
en la Guía general para autores de Biota Colombiana.
Recuerde
adjuntar:
•
Plantilla de Excel con la última versión de los datos revisada por el EC-SiB.
•
Documento de Word con las figuras y tablas seguidas de una lista las mismas.
Cuando finalice el proceso, sus datos se harán públicos y de libre
acceso en los portales de datos del SiB Colombia y GBIF. Esto permitirá que sus
datos estén disponibles para una audiencia nacional e internacional,
manteniendo siempre el crédito para los autores e instituciones asociadas.
The
purpose of this guide is to establish and explain the necessary steps to
prepare a manuscript with the potential to become a publishable data paper in
Biota Colombiana. This guide includes aspects related to the preparation of
both data and the manuscript.
What is a Data Paper?
A data
paper is a scholarly publication that has emerged as a mechanism to encourage
the publication of biodiversity data as well as an approach to generate
appropriate academic and professional recognition to all those involved in in
the management of biodiversity information.
A data paper contains the basic sections of a traditional
scientific paper. However, these are structured according to an international
standard for metadata (information that gives context to the data) known as the
GBIF Metadata Profile (GMP)5. The structuring of the
manuscript based on this standard enables the community of authors publishing
datasets globally, with presence in networks such as the Global Biodiversity
Information Facility (GBIF) and other related networks, to publish data easily
while getting proper recognition for their work and to encourage the authors of
this type of data sets that have not yet published in these global information
networks to have the necessary incentives to do so.
A data paper should describe in the best possible way the Whom,
What, Where, When, Why and How of documenting and recording of data, without
becoming the instrument to make a detailed analysis of the data, as happens in
other academic publications. To deepen this publishing model, it is recommended
to consult Chavan & Penev (2011)6.
Which
manuscripts are suitable for publication as data paper?
Manuscripts
that describe datasets containing original primary biological records (data of
occurrences in a particular place and time); information associated with
specimens of biological collections, thematic or regional inventories of
species, genomic data and all data likely to be structured with the standard Darwin
CoreDarwin Core7 (DwC). This standard is used in the
community of authors publishing biodiversity datasets to structure the data and
thus to consolidate and integrate from different sources globally. It is not
recommended to submit manuscripts describing secondary datasets, such as
biological records compilations from secondary sources (e.g. literature or
compilations of records already published in networks such as GBIF or IABIN).
Dataset
preparation
As
mentioned above data submitted in this process should be structured based on
DwC standard. For ease of structuring, the Biodiversity Information System of
Colombia (SiB Colombia), created two templates in Excel; one for occurrences
and other for species checklist. Carefully read and follow the template
instructions for structuring and publishing data. For any questions about the
structure process of data please contact the Coordinator Team of SiB Colombia
(EC-SiB) at sib+iac@humboldt.org.co
Manuscript
preparation
To assist
the creation and structuring of the manuscript in the GMP standard, an
electronic writing tool is available (http://ipt.sibcolombia.net/biota) to
guide the author in the process and ultimately generate a first version of the
manuscript. The use of GMP manual as an information guide to include in each
section of the manuscript, as well as the annex 1 is recommended.
Steps
required for the manuscript preparation:
1 Request
access to the electronic writing tool at sib+iac@humboldt.org.co. The EC-SiB
will assign a username and password.
2. Login
to the electronic writing tool, then go to the tab Manage Resources and create
a new resource by assigning a short name for your manuscript and clicking on
the Create button. Use the format: “InstitutionAcronym_Year_DatasetFeature”,
e.g. NMNH_2010_rainforestbirds.
3. In the overview of the writing tool click on edit in Metadata
section (please, do not use any other section), once there you will find
different sections (right panel) that will guide you creating your manuscript.
Save the changes at the end of each section, otherwise you will lose the
information. Remember to use the GMP manual. Here are some recommendations for
editing the metadata, sections are indicated in CAPS and the elements of these
sections in bold.
• In
ASSOCIATED PARTIES include only those who are not listed in BASIC INFORMATION.
• PROJECT
DATA and COLLECTION DATA are optional depending on the data type. When using
these sections extend or complement information already provided, i.e. do not
repeat the same information describing the description (GEOGRAPHIC
COVERAGE) in the study area description (PROJECT DATA).
•
Likewise, in SAMPLING METHODS, you must expand or complete the information, not
repeat it. The information in study extent should give a specific
context of the sampling methodology.
• It is
essential to document the quality control in SAMPLING METHODS. Here you
should describe what tools or protocols were used to ensure the quality and
consistency of data structured with DwC standard.
• To
create the resource citation in the CITATIONS section, follow one of the
two formats proposed (Annex 2). Do not fill out the citation identifier, this
will be provided later by the EC-SiB.
• To
include the manuscript bibliography in citations, enter each of the
citations individually, adding a new citation each time by clicking in the
bottom left.
4. Check
that the format of the information provided meets the guidelines of the journal
(e.g. abbreviations, units, number formatting, etc.) in the Biota Colombiana
Guidelines for Authors.
5. Once
included and verified all information in the writing tool, notify to EC-SiB at
sib+iac@humboldt.org.co, indicating that you have finished editing the
manuscript. Additionally attach the Excel template with structured data (remove
all columns that were not used). The EC-SiB will perform corrections and final
recommendations about the structure of the data and give you the final
instructions to submit the paper.
Submit
the manuscript
Once you
have finished editing your manuscript and getting the instructions from EC-SIB,
send a letter submitting your article to email biotacol@humboldt.org.co,
following the instructions of Biota Colombiana Guidelines for Authors.
Remember
to attach:
• Excel
template with the latest version of the data reviewed by the EC-SiB.
• Word document with figures and tables
followed by a list of them.
At the end of the process, your information will be public and
freely accessible in the data portal of SiB Colombia and GBIF. This will allow
your data to be available for national and international audience, while
maintaining credit to the authors and partner institutions.